13 сентября канонерка «Беспощадный» несколько часов вела безрезультатную артиллерийскую дуэль с белой батареей в районе Рынка. Прибыло сторожевое судно № 105, ушли в ремонт «Товарищ», «Бдительный» и сторожевое судно № 106.
20 сентября части Красной Армии вновь начали наступление на Царицын. Флотилия поддерживала их артиллерийским огнем. Три аэроплана атаковали канонерку «Буревестник», на судне пробит борт, 13 человек ранено. В тот же день «Буревестник» и «Беспощадный» отправились в Нижний Новгород на ремонт, а там после обследования инженерами были сданы Обводу «за негодностью».
23 сентября отряд Кожанова при самой активной поддержке судов флотилии захватил поселок Рынок. В это время четыре канонерки ГВИУ и три сторожевых судна обстреливали поселок Мокрая Мечеть. Три самолета бомбили «Буйный», он получил несколько пробоин, 8 человек ранено.
На следующий день кожановцы оставили Рынок, а части 28-й дивизии — позиции у Мокрой Мечети.
24 сентября канонерка «Товарищ» при маневрировании протаранила сторожевое судно № 105 (бывший малый буксир), судно затонуло.
Несколько недель в 15–30 км севернее Царицына шла позиционная война с переменным успехом. 10 октября «Борец за Свободу» и четыре канонерки ГВИУ спустились до Рынка и обстреляли позиции белых. На следующий день суда флотилии интенсивным огнем поддерживали новое наступление 28-й дивизии. Белые поставили несколько минных заграждений, в том числе у Французского завода, у Орудийного завода и у моста в Ерик.
16 октября авиаотряд флотилии ушел в Нижний Новгород. Всего в августе — сентябре 1919 г. морские летчики воздушного дивизиона флотилии совершили 21 разведывательный полет и 5 ночных бомбардировок Царицына и Сарепты. В связи с отсутствием наземной связи между Северной и Южной частями флотилии морской летчик Сергей Козлов совершил ночью двухсоткилометровый перелет через занятую белыми территорию из Дубовки до Черного Яра, а на следующую ночь перелетел обратно.
19 октября части красных стали отходить от Царицына на север. Флотилия тоже перебазировалась севернее, в район Водяное — Песковатка. 20 октября канонерки «Маркин», «Беспощадный» и «Буревестник» на буксире теплохода «Малоросс» ушли в Нижний Новгород. У канонерок машины вышли из строя, и от стрельбы сильно расшатан корпус. По пути их атаковали шесть самолетов противника, но прямых попаданий бомб не было.
21–22 октября оставшиеся суда поддерживали огнем сухопутные части в районе севернее Царицына.
23 октября ушли вверх по Волге «Красное Знамя», «Бедовый» и «Стенька Разин».
25 октября Северная часть Волжско-Каспийской флотилии официально закончила кампанию. На фронте остались канонерки «Карл Маркс», «Память Володарского», «Бурный» и два тральщика. Командовать ими был назначен Кожанов. В тот же день на остальные суда белая авиация произвела налет, сбросив 30 бомб. На следующий день белые произвели новый налет и сбросили 25 бомб. После налета воен-моры набрали полшлюпки рыбы, в основном осетровых.
28 октября командир канонерки «Память Володарского» обнаружил в канале 102-мм пушки штуртрос, а рулевой в рулевой машинке — болт. Тем не менее канонерка «Память Володарского» сумела обстрелять деревню Песковатку. 31 октября на канонерке «Буйный» возник пожар, который с трудом потушили.
3 ноября канонерка «Память Володарского» произвела два обстрела Песковатки, а на следующий день все три канонерки обстреляли занятую белыми Дубовку и привели к молчанию четырехорудийную батарею белых.
5–7 ноября канонерки периодически обстреливали Дубовку. На этом боевые действия окончательно закончились. 8 ноября большая часть судов Северной части Волжско-Каспийской флотилии пришла на зимовку в Нижний Новгород.
А теперь перейдем к боевым действиям части Волжско-Каспийской флотилии, оказавшейся после падения Царицына южнее его.
Для действий на Волге ниже Царицына командование Волжско-Каспийской флотилии создало Верхнеастраханский отряд под командованием А. К. Векмана. Согласно приказу Раскольникова от 23 июля 1919 г., суда Верхнеастраханского отряда были рассредоточены на Нижней Волге следующим образом.
Вооруженный пароход «Рошаль» («Парс»), плавбатареи № 1 (баржа «Ярополк») и № 3 (баржа «Вячеслав»), вооруженные каждая двумя 152/45-мм пушками Кане, а также 18-й воздухоотряд базировались на Владимировку. Суда были подчинены сухопутному начальству боевого участка левого берега Волги.
Вооруженный пароход «Коммунист» (пароход «Сережа» водоизмещением 370 т; длина 32,5 м; ширина 6,8 м; осадка 1,8 м; машина мощностью 370 л.с., скорость 11 узлов. Вооружение: одна 102/60-мм и одна 75-мм пушки, два пулемета) базировался на село Старицкое.
В Черном Яре базировался миноносец «Расторопный».
Вооруженный пароход «Спартаковец» (до 26 марта 1919 г. «Севск», буксирный пароход, построенный в 1904 г. в Саратове. Длина 36,2 м; ширина 5,8 м; осадка 1,9 м; машина мощностью 900 л.с.; скорость 11 узлов. Вооружение: две 75-мм пушки и три пулемета) крейсировал от села Никольское до города Енотаевска, а пароход «Советский» (до 28 февраля 1919 г. «Леонтий», буксирный пароход, построенный в 1912 г. в Астрахани; длина 28,2 м; ширина 5,3 м; осадка 1,2 м; машина мощностью 200 л.с.; скорость 10 узлов. Вооружение: две 75-мм пушки и три пулемета) крейсировал от Енотаевска до села Большое Лебяжье. Следует заметить, что в районе Енотаевска действовали банды калмыков.