Также в Медвежью Гору по железной дороге были доставлены десять английских малых моторных катеров, вооруженных одной 47-мм, одной 37-мм пушками и одним пулеметом каждый.
Кроме того, белые вооружили два малых буксирных парохода «Светлана» и «Азот» 76-мм и 47-мм пушками. Командующим белой Онежской флотилией стал капитан 1-го ранга А. Д. Кира-Динжан, бывший командир дивизиона сторожевых катеров Балтийского флота.
18 мая для огневой поддержки частей Красной Армии в район станции Медвежья Гора из Петрозаводска были отправлены канонерские лодки № 1 и № 5, но, встретив в Заонежском заливе лед толщиной 1–1,5 м и не будучи в состоянии пробиться через него, канонерки повернули обратно. 23 мая они вторично попытались пройти Повенецкий залив, но и на этот раз безрезультатно. Таким образом, красным не удалось воспрепятствовать созданию белой флотилии.
«Противник, использовав это природное препятствие, энергично работал над устройством и укреплением базы на станции Медвежья Гора и сумел использовать настроение населения полуострова Заонежье и восточного берега озера, где на почве голода было сильное недовольство Советской властью; после того как агитация со стороны белых была подкреплена английским продовольствием, им не стоило больших трудов приступить к вербовке добровольцев и организации партизанских отрядов. Через несколько дней восстанием были охвачены Шуньгская и Челмужская волости, куда 24 мая из Петрозаводска вышли канонерские лодки № 4, № 6 и транспорт «Роза Люксембург» с (десантным) отрядом в 70 человек. С этого момента по существу и начались боевые действия флотилии. Отряд, оперировавший в районе Шуньгской и Толвуйской волостей, был доведен до 300 человек; кроме того, был высажен в д. Песчаный Погост отряд в 200 чел., для операции на восточном побережье озера».
Суда красных установили постоянный дозор в районе островов Мег, Речной и Сал.
1 июня канонерка № 5, ведя на буксире паровой катер с двадцатью красноармейцами, вышла из села Толвуй к деревне Федото-во для установления связи с частями, действовавшими на железнодорожном участке против станции Медвежья Гора. В тот момент, когда катер направился к берегу, из Шуньгской Губы показался моторный катер, шедший в северо-западном направлении к катеру красных. Канонерка № 5, идя полным ходом на пересечение курса, на дистанции в 30 кабельтовых вступила с этим катером в бой, который продлился около получаса. Однако, попаданий ни с той, ни с другой стороны не было, и катер, используя свое преимущество в скорости, скрылся за остров Цинг.
4 июня к деревне Федотове вышли канонерки № 4 и № 6, а канонерка № 8 осталась в дозоре у острова Речной. На траверзе Ажеп-ского маяка, в двух милях, был замечен катер-истребитель белых, сразу же открывший из 57-мм пушки огонь по красным канонеркам. Те открыли ответный огонь, при этом медленно склоняясь вправо, так как истребитель, идя параллельным курсом со скоростью около 20 узлов, быстро обогнал их, выйдя из угла обстрела 75-мм кормовых орудий.
Через полчаса у входа в Шуньгскую Губу показался второй катер, шедший на северо-восток и открывший с дистанции 30 кабельтовых огонь из 47-мм пушки. Канонерки, попав под перекрестный огонь, повернули на восток, продолжая обстреливать оба катера, которые вскоре скрылись: первый — в Шуньгскую Губу, второй — за остров Цинг.
Командование Онежской флотилии решило 5 июня захватить поселок Шуньгу. Согласно плану, из Толвуя вышли канонерки № 4, № 6 и № 8 с десантом. Места высадки намечались в деревнях Падм-озеро (в 8 км севернее Толвуя) и Шуныский бар. После высадки, проведенной при поддержке артиллерийского огня канонерок, с севера близ Ажепского маяка показалось четыре катера белых. Бой начался с дистанции 30 кабельтовых. После того как канонерки пристрелялись и снаряды стали падать около катеров, последние, имея строй фронта, повернули все вдруг на 16 румбов и, пользуясь преимуществом хода, скрылись.
8 этот день «из-за неустойчивости настроения отряда» десант был принят обратно на борт, и суда отошли к Толвую, а затем — к деревне Кузаранда.
7 июня канонерки № 4, № 6 и № 8, находившиеся в дозоре к югу от острова Men подверглись атаке «Фэйри-IIIС», пилотируемого летчиками Хайнсом и Идсом. Гидросамолет сбросил одну 112-фунтовую и три 20-фунтовые бомбы. Тогда красные канонерки не имели зенитных орудий, и им ничего не оставалось делать, как «разойтись по радиусам на дистанцию, позволявшую двум из них обстреливать гидроаэроплан, атакующий третью. Из четырех бомб, сброшенных на канлодку № 8, и четырех — на канлодку № 4 — ни одна не попала».
9 июня гидросамолет «Фэйри» несколько раз бомбардировал дозорные канонерские лодки. «В 4 ч. гидроаэроплан сбросил безрезультатно 4 бомбы на канлодку № 7; в 5 час. — 4 бомбы на канлодку № 2. В это же время бронированный бомбовоз (выделено мной. — А. Ш.) сбросил 21 бомбу на канлодку № 2 и 7 бомб на канлодку № 7.
Одновременно аппараты обстреливали канлодки из пулеметов, на что последние отвечали главным образом ружейным огнем, так как установленные своими средствами для вертикальной стрельбы пулеметы действовали из-за перекоса лент плохо; малодейственен был и орудийный огонь. 11 июня три гидроаэроплана произвели очередную атаку наших дозорных судов. Аппараты обыкновенно снижались до 50 метров, тем не менее ни серьезных повреждений, ни раненых с нашей стороны не было, если не считать трех легкораненых на канлодке № 7».