Гитлер с весны 1941 г. не проявлял никакого интереса к Балканам и полностью передоверил решение всех здешних вопросов итальянцам. С развитием событий в этом регионе ему пришлось корректировать свое отношение. Уже в конце 1941 г. по инициативе начальника разведцентра абвера в Белграде капитана Матля, хорошо знавшего Балканы, были установлены контакты между штабом командующего немецкими войсками в Сербии и генералом Михайловичем. Переговоры состоялись в ночь на 15 ноября 1941 г. в селении Дивичи на реке Колобаре. Однако они закончились безрезультатно, т. к. представители штаба немецких войск в Сербии и немецкой полевой полиции выдвинули требование о безоговорочной капитуляции четников, хотя Михайлович предлагал им нести охрану важных для немцев путей сообщения, если они оставят в покое его отряды четников в горах, где они практически господствовали. После неудачи переговоров в Дивичах военная обстановка снова обострилась, а еще через некоторое время Михайлович перебрался из Сербии в Черногорию.
Капитан Матль тогда же завязал отношения с восточнобоснийским лидером четников майором Данжичем. Когда в ходе одной операции по зачистке Матль увидел своими глазами следы страшных преступлений хорватских усташей в отношении сербского гражданского населения, он решил умиротворить Восточную Боснию. Эта область практически находилась в ведении немецкого командующего в Сербии, а политическое руководство там осуществлял по соизволению Гитлера лидер Усташи генерал Анте Павелич. Капитан Матль в своих начинаниях встретил полную поддержку у нового начальника штаба группы немецких войск полковника Кевиша. С его согласия Матль однажды ночью в конце 1941 г. пересек на лодке Дрину и в селении Кулине, контролируемом четниками, встретился с майором Данжичем. Они договорились о встрече генерала Недича с полковником Кевишем в присутствии Данжича и Матля. Встреча состоялась в Белграде на квартире у Кевиша. Но и на этой встрече цель усмирения сербского сопротивления согласована не была. Тем не менее Матль и Кевиш совместно добились того, что около 1000 боснийских четников в лагере Бабач признали себя военнопленными и тем самым избежали нападения усташей.
В таком ненадежном и недостаточно контролируемом немецкими оккупационными войсками районе ни абвер, ни военные штабы не могли не касаться в своих докладах также и политических сторон балканской проблемы, столь неудачно решенной Гитлером и Муссолини. Не могли они и не делать соответствующих выводов из своих наблюдений и полученного опыта. И зимой 1942/43 г. Матль и его сотрудник капитан Бюргер изложили заехавшему в Белград германскому министру Нойбахеру всю обстановку в Югославии и Албании без всяких прикрас. Они особенно подчеркивали дикие, опустошительные карательные меры и «экспедиции» немецких полицейских частей против беззащитного гражданского населения. Все это только усиливало начинавшееся тогда сопротивление оккупантам. Министр Нойбахер, который должен был делать доклад Гитлеру о положении на Балканах, был серьезно удивлен всем, что ему рассказали. Но когда он в Берлине попытался передать Гитлеру доводы абвера, тот резко его оборвал. А почти ровно год спустя, 7 февраля 1944 г., в докладе об обстановке, составленном штабом службы связи ВМС в Хорватии за период с начала декабря 1943 г. до конца января 1944 г., указывалось следующее: «Тито полностью господствует в стране, а в Усташе народ видит только врага». Высказаться яснее было просто невозможно. Посевы насилия вызвали ответное насилие. А по мнению абвера, при своевременном учете интересов сторон вполне можно было, используя тайную службу, прийти к соглашению с Тито. В течение 1943 г. Тито сам пытался через генерала Велебита (он же доктор Петрович) заключить соглашение с командованием оккупационных войск. Однако Гитлер оставил без ответа присланную ему из Аграма реляцию командующего немецкими войсками в Хорватии генерала Глайзе-Хорстенау. А своим приближенным заявил: «Переговоров с партизанами я не веду!»
В начале 1943 г. капитан Матль совместно с капитаном Киршем из абвера-II создали в пограничной зоне между Югославией и Албанией склады оружия на случай капитуляции Италии, чтобы сразу же занять аэродромы и разоружить итальянские части. Это было крайне важно, т. к. существовала опасность, что англичане сумеют упредить немцев высадкой здесь воздушного десанта и тем самым создать угрозу немецким путям подвоза снабжения в Греции. Когда летом 1943 г. немецким войскам пришлось в течение суток занять этот приграничный район, быстрота этой операции была исключительно заслугой абвера.
Развернувшееся на Востоке в оккупированных областях мощное партизанское движение было далеко не спонтанным «восстанием свободолюбивого советского народа против немецких захватчиков», как это было представлено в СССР и закреплено «исторически». Скорее всего, оно подготавливалось властями чуть ли не с конца Гражданской войны в предвидении такой ситуации. Под контролем партийных организаций из невоенных и имевших бронь по работе еще в мирное время формировались взводы по 25 человек и отделения по 8 человек. Они проходили военное обучение и должны были в случае захвата противником их района немедленно начать диверсии за линией фронта. В первые недели, во время продвижения немецких войск в глубь страны, эти вначале мелкие группы уходили в леса. Значительную долю в них составляли специально остававшиеся в тылу немецких войск сотрудники НКВД, партийные функционеры и отбившиеся от своих частей красноармейцы. Поначалу население относилось к ним без симпатии: оно до конца 1941 г. надеялось, что немцы несут ему подлинное освобождение от большевизма. Когда же эти надежды не оправдались и когда бежавшие из немецких лагерей русские военнопленные рассказали о том, что они пережили в этих лагерях, и когда вдобавок к этому многие большевики проникли в местные немецкие органы управления, а политика рейхскомиссаров и СС заставила тысячи русских, украинцев и белорусов искать спасения в лесах, партизаны стали получать все больше и больше подкреплений.